全自動菌落計數(shù)儀一般采用成像分析法實現(xiàn)自動計數(shù)，即由成像硬件，分析軟件組成，成像硬件用于獲得清晰有效的菌落圖像，以便分析計數(shù)。現(xiàn)今的成像硬件有拍照成像的、掃描成像的。由攝像頭拍照成像的優(yōu)點是：成像速度快，能確保在0.5秒內(nèi)獲得菌落圖像。由單反相機、卡片機拍照成像的優(yōu)點是：能自動對焦、且像素分辨率一般更高，但其成像需要3-4秒的時間。分析軟件能夠自動校正背景、將嚴重粘連在一起的團裝、鏈狀分布菌落自動分割開來；能自動識別菌落計數(shù)分類以及對抗生素效價分析、藥敏分析功能等。

　　全自動菌落計數(shù)儀是一種幫助實驗人員對菌落進行計數(shù)的儀器，可以減輕實驗人員的勞動強度，提高工效，提高工作質(zhì)量，是各級防疫站、環(huán)境監(jiān)測站、食品衛(wèi)生監(jiān)督檢驗所、醫(yī)院、生物制品所、藥檢所、商檢局、食品廠、飲料廠、化妝品廠、日化廠及大專院校、科研單位實驗室等的儀器。

　　采用高清晰數(shù)字CCD相機，快速讀取平板菌落數(shù)，節(jié)省大量的人力和時間；測定結(jié)果重現(xiàn)性好，可避免人工計數(shù)所帶來的人為誤差；配套的專業(yè)分析軟件具有區(qū)分菌落和培養(yǎng)基、雜質(zhì)不同光學特性的能力，如培養(yǎng)基顏色、厚度、菌落大小、顏色、隆起狀況、密集性和蔓延性等，篩選特定菌落；能對抗生素的抑菌圈做精確的描述和記錄，能進行稀釋系數(shù)校正等一系列有關(guān)運算；計數(shù)數(shù)據(jù)和結(jié)果自動傳輸?shù)接嬎銠C，數(shù)據(jù)自動處理，儲存平板圖像，為監(jiān)督檢測提供有效的法律依據(jù)等。菌落分析儀廣泛應用于食品和飲料的品質(zhì)和衛(wèi)生檢驗、水質(zhì)分析、乳及乳制品的檢測、醫(yī)院臨床檢驗、化妝品檢驗和藥品的品質(zhì)和質(zhì)量檢測等等，適用于對微生物的菌落計數(shù)和計算、抗生素的抗菌性測試和菌種篩選等。